Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tns3Q5SSZ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms