Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms