Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85aQ5SP85 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms