Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms