Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnni3kQ5GIG6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3kQ5GIG6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms