Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ecm2Q5FW85 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms