Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms