Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Snhg11Q4G0K9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Snhg11Q4G0K9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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