Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn3Q499D0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms