Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms