Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms