Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms