Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3V0E1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms