Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbm44Q3V089 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbm44Q3V089 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbm44Q3V089 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rbm44Q3V089 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbm44Q3V089 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rbm44Q3V089 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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