Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ttc9Q3V038 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc9Q3V038 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc9Q3V038 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc9Q3V038 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc9Q3V038 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc9Q3V038 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc9Q3V038 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms