Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms