Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn13Q3UW68 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms