Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnga4Q3UW12 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms