Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms