Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms