Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3USZ8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3USZ8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3USZ8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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