Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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