Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3UPC7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms