Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrch2Q3UMG5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms