Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsg1Q3UM18 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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