Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc33Q3ULW6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms