Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upf3bQ3ULL6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms