Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Usp19Q3UJD6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp19Q3UJD6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Usp19Q3UJD6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Usp19Q3UJD6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Usp19Q3UJD6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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