Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms