Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll12Q3UDE2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll12Q3UDE2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms