Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms