Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ulk3Q3U3Q1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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