Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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