Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms