Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hace1Q3U0D9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms