Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl4Q3TZA2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms