Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TchpQ3TVW5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms