Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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