Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms