Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms