Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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