Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec11Q3SXB8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms