Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam178bQ24JP3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam178bQ24JP3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms