Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sap25Q1EHW4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms