Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cers3Q1A3B0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cers3Q1A3B0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms