Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Fam47cQ14BE7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Fam47cQ14BE7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Fam47cQ14BE7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Fam47cQ14BE7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam47cQ14BE7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47cQ14BE7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms