Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms