Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms