Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neurl1bQ0MW30 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neurl1bQ0MW30 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Neurl1bQ0MW30 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms