Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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